Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0
Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23203-201 | ENSMUST00000104374 | 107 nt | BASIC | 1,4 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25160-201 | ENSMUST00000158914 | 102 nt | BASIC | 1,4 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | AC158537.2-201 | ENSMUST00000223575 | 150 nt | BASIC | 1,4 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | AC160550.1-201 | ENSMUST00000228659 | 181 nt | BASIC | 1,4 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Snord69-201 | ENSMUST00000104024 | 80 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22030-201 | ENSMUST00000116942 | 63 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25964-201 | ENSMUST00000157171 | 97 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26089-201 | ENSMUST00000157898 | 107 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25693-201 | ENSMUST00000175443 | 85 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm38323-201 | ENSMUST00000192450 | 210 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm43927-201 | ENSMUST00000204599 | 117 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm43944-201 | ENSMUST00000205220 | 120 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23570-201 | ENSMUST00000083029 | 104 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir500-201 | ENSMUST00000093600 | 92 nt | BASIC | 1,39 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Arhgap5-204 | ENSMUST00000219443 | 9323 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,38 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | B230307C23Rik-201 | ENSMUST00000113729 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 1,38 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Rab11fip4os2-202 | ENSMUST00000132921 | 355 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1,38 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22980-201 | ENSMUST00000082608 | 70 nt | BASIC | 1,38 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir219a-2-201 | ENSMUST00000083551 | 97 nt | BASIC | 1,38 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25506-201 | ENSMUST00000104339 | 70 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25847-201 | ENSMUST00000116793 | 96 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24290-201 | ENSMUST00000157634 | 96 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25950-201 | ENSMUST00000175331 | 100 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23306-201 | ENSMUST00000179058 | 105 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm21954-201 | ENSMUST00000179544 | 51 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm20305-201 | ENSMUST00000193226 | 177 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24311-201 | ENSMUST00000082570 | 104 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25128-201 | ENSMUST00000083339 | 76 nt | BASIC | 1,37 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Snhg14-211 | ENSMUST00000189581 | 6861 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Olfr1100-202 | ENSMUST00000117211 | 2937 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25496-201 | ENSMUST00000104430 | 120 nt | BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26363-201 | ENSMUST00000158866 | 83 nt | BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22095-201 | ENSMUST00000158984 | 150 nt | BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | AC116319.1-201 | ENSMUST00000227765 | 222 nt | BASIC | 1,36 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23785-201 | ENSMUST00000116741 | 96 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22233-201 | ENSMUST00000157464 | 114 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23893-201 | ENSMUST00000158106 | 134 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25868-201 | ENSMUST00000158253 | 114 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22074-201 | ENSMUST00000158595 | 113 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22466-201 | ENSMUST00000175278 | 69 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26499-201 | ENSMUST00000178544 | 79 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26096-201 | ENSMUST00000179084 | 79 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23301-201 | ENSMUST00000082713 | 65 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24208-201 | ENSMUST00000082783 | 135 nt | BASIC | 1,35 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir1197-201 | ENSMUST00000117037 | 120 nt | BASIC | 1,34 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25622-201 | ENSMUST00000157217 | 104 nt | BASIC | 1,34 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25354-201 | ENSMUST00000179110 | 105 nt | BASIC | 1,34 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm43038-201 | ENSMUST00000202359 | 88 nt | BASIC | 1,34 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir30a-201 | ENSMUST00000083471 | 71 nt | BASIC | 1,34 | □□□□□ -2,19 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Olfr832-202 | ENSMUST00000218385 | 4435 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir216b-201 | ENSMUST00000102363 | 86 nt | BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23826-201 | ENSMUST00000157394 | 119 nt | BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24073-201 | ENSMUST00000158177 | 106 nt | BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24549-201 | ENSMUST00000158647 | 139 nt | BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25798-201 | ENSMUST00000082641 | 107 nt | BASIC | 1,33 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm6293-201 | ENSMUST00000050339 | 195 nt | BASIC | 1,32 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24918-201 | ENSMUST00000083022 | 130 nt | BASIC | 1,32 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir10b-201 | ENSMUST00000083566 | 68 nt | BASIC | 1,32 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | n-R5s157-201 | ENSMUST00000122543 | 121 nt | BASIC | 1,31 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22788-201 | ENSMUST00000157876 | 61 nt | BASIC | 1,31 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22541-201 | ENSMUST00000158165 | 127 nt | BASIC | 1,31 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25756-201 | ENSMUST00000103990 | 136 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm6272-201 | ENSMUST00000121256 | 171 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23291-201 | ENSMUST00000175611 | 78 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23726-201 | ENSMUST00000178937 | 67 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25870-201 | ENSMUST00000179845 | 79 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir6381-201 | ENSMUST00000183426 | 87 nt | BASIC | 1,3 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25619-201 | ENSMUST00000122621 | 104 nt | BASIC | 1,29 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25366-201 | ENSMUST00000158845 | 124 nt | BASIC | 1,29 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26359-201 | ENSMUST00000158873 | 101 nt | BASIC | 1,29 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24202-201 | ENSMUST00000082948 | 103 nt | BASIC | 1,29 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir377-201 | ENSMUST00000083504 | 68 nt | BASIC | 1,29 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22786-201 | ENSMUST00000104086 | 122 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm26485-201 | ENSMUST00000158019 | 64 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22203-201 | ENSMUST00000158605 | 58 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24221-201 | ENSMUST00000158833 | 313 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir3079-201 | ENSMUST00000175428 | 90 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm42533-201 | ENSMUST00000196247 | 157 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm43907-201 | ENSMUST00000203128 | 117 nt | BASIC | 1,28 | □□□□□ -2,2 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Traj13-201 | ENSMUST00000103728 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 1,27 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir27b-201 | ENSMUST00000083541 | 73 nt | BASIC | 1,27 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm25991-201 | ENSMUST00000102439 | 99 nt | BASIC | 1,26 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir1904-201 | ENSMUST00000122702 | 80 nt | BASIC | 1,26 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir100-201 | ENSMUST00000175270 | 80 nt | BASIC | 1,26 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22413-201 | ENSMUST00000175465 | 85 nt | BASIC | 1,26 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | AC211878.4-201 | ENSMUST00000220970 | 262 nt | BASIC | 1,26 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Vmn1r75-202 | ENSMUST00000226622 | 6638 nt | APPRIS P2 BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm11111-201 | ENSMUST00000112956 | 99 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23991-201 | ENSMUST00000117033 | 93 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm11966-201 | ENSMUST00000119907 | 87 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm6985-201 | ENSMUST00000121255 | 271 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23853-201 | ENSMUST00000158375 | 104 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm22406-201 | ENSMUST00000174923 | 93 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir22-201 | ENSMUST00000083595 | 95 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm23347-201 | ENSMUST00000083823 | 82 nt | BASIC | 1,25 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24983-201 | ENSMUST00000104457 | 69 nt | BASIC | 1,24 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm10974-201 | ENSMUST00000107486 | 126 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1,24 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Gm24500-201 | ENSMUST00000158447 | 124 nt | BASIC | 1,24 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir3064-201 | ENSMUST00000175532 | 67 nt | BASIC | 1,24 | □□□□□ -2,21 | | |
Pdzrn3 | Q69ZS0 | Mir6342-201 | ENSMUST00000183870 | 125 nt | BASIC | 1,24 | □□□□□ -2,21 | | |
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109,7 ms