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Protein–RNA interactions for Protein: Q62277
Syp, Synaptophysin, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Syp
Q62277
Gm22640-201
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79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25984-201
ENSMUST00000179129
79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25585-201
ENSMUST00000179469
79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm26374-201
ENSMUST00000179737
79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm24040-201
ENSMUST00000179786
79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25017-201
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79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm23618-201
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79 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm26284-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm24570-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm24654-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Mir7065-201
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25684-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm26421-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25889-201
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107 nt
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm23291-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm44327-201
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm22509-201
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm23969-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm22490-201
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BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm23994-201
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88 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm22088-201
ENSMUST00000158341
117 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25337-201
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104 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm6358-201
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156 nt
APPRIS ALT2
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm11749-201
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184 nt
TSL 2
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm26152-201
ENSMUST00000157427
101 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Snord2-201
ENSMUST00000157899
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BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm25366-201
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124 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm26712-201
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217 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Gm37796-201
ENSMUST00000195327
134 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Syp
Q62277
Mir6896-201
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73 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
CT009723.2-201
ENSMUST00000215702
124 nt
TSL 5
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
mt-Tf-201
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BASIC
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Syp
Q62277
Mir29a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
Gm23012-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
n-R5s18-201
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BASIC
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Syp
Q62277
Scarna8-201
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BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
Mir5124a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.37
Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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TSL 1 (best)
BASIC
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Syp
Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
AC153930.1-201
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TSL 3
BASIC
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Syp
Q62277
AC140930.2-201
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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Q62277
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Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
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Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
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Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.38
Syp
Q62277
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.38
Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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BASIC
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Syp
Q62277
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89 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm26007-201
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120 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm25952-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Mir8107-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm29047-201
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm24148-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm23020-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm22406-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm25656-201
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66 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Mir3065-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
Gm22004-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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□□□□□ -2.39
Syp
Q62277
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Q62277
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Q62277
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Syp
Q62277
n-R5s12-201
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Q62277
Gm24234-201
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107 nt
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BASIC
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Syp
Q62277
Gm24877-201
ENSMUST00000158779
116 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
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