Protein–RNA interactions for Protein: Q61136
Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Prpf4b | Q61136 | Gm22212-201 | ENSMUST00000158096 | 106 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm27475-201 | ENSMUST00000183420 | 61 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir7065-201 | ENSMUST00000185110 | 61 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm3702-201 | ENSMUST00000211754 | 346 nt | BASIC | 0,33 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25408-201 | ENSMUST00000104104 | 133 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23291-201 | ENSMUST00000175611 | 78 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm44490-201 | ENSMUST00000198566 | 127 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC153930.1-201 | ENSMUST00000220016 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25337-201 | ENSMUST00000083723 | 104 nt | BASIC | 0,32 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23012-201 | ENSMUST00000104149 | 83 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Snord2-201 | ENSMUST00000157899 | 69 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26456-201 | ENSMUST00000082831 | 111 nt | BASIC | 0,31 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir670-201 | ENSMUST00000102380 | 100 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25366-201 | ENSMUST00000158845 | 124 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25678-201 | ENSMUST00000174984 | 73 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir509-201 | ENSMUST00000196089 | 75 nt | BASIC | 0,3 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26478-201 | ENSMUST00000122611 | 133 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23783-201 | ENSMUST00000157941 | 102 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24772-201 | ENSMUST00000158507 | 110 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Sult1c2-ps2-201 | ENSMUST00000196414 | 276 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir224-201 | ENSMUST00000083608 | 82 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26109-201 | ENSMUST00000083970 | 70 nt | BASIC | 0,29 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22203-201 | ENSMUST00000158605 | 58 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25633-201 | ENSMUST00000178565 | 107 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC157602.1-201 | ENSMUST00000197446 | 105 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC166341.8-201 | ENSMUST00000221267 | 108 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC140930.2-201 | ENSMUST00000221803 | 109 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22828-201 | ENSMUST00000083768 | 107 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23347-201 | ENSMUST00000083823 | 82 nt | BASIC | 0,28 | □□□□□ -2,36 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir1197-201 | ENSMUST00000117037 | 120 nt | BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Rab11fip4os2-202 | ENSMUST00000132921 | 355 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0,27 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir710-201 | ENSMUST00000102088 | 110 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24833-201 | ENSMUST00000116775 | 120 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | mt-Tf-201 | ENSMUST00000082387 | 68 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24697-201 | ENSMUST00000083881 | 107 nt | BASIC | 0,26 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22340-201 | ENSMUST00000157717 | 114 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25375-201 | ENSMUST00000158157 | 135 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Scarna8-201 | ENSMUST00000158333 | 131 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | CT009723.2-201 | ENSMUST00000215702 | 124 nt | TSL 5 BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25815-201 | ENSMUST00000082755 | 107 nt | BASIC | 0,25 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23821-201 | ENSMUST00000158738 | 106 nt | BASIC | 0,24 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22981-201 | ENSMUST00000082611 | 75 nt | BASIC | 0,24 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir18-201 | ENSMUST00000083469 | 96 nt | BASIC | 0,24 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24234-201 | ENSMUST00000104316 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24983-201 | ENSMUST00000104457 | 69 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22770-201 | ENSMUST00000158368 | 67 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23020-201 | ENSMUST00000158766 | 253 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25161-201 | ENSMUST00000158913 | 132 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir7077-201 | ENSMUST00000183991 | 57 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC132833.2-201 | ENSMUST00000228699 | 157 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23140-201 | ENSMUST00000082487 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25987-201 | ENSMUST00000083234 | 107 nt | BASIC | 0,23 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23531-201 | ENSMUST00000104567 | 68 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24586-201 | ENSMUST00000116695 | 89 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26253-201 | ENSMUST00000122493 | 103 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | n-R5s18-201 | ENSMUST00000122740 | 121 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26007-201 | ENSMUST00000158798 | 120 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir3108-201 | ENSMUST00000175500 | 79 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm28001-201 | ENSMUST00000183561 | 117 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir6365-201 | ENSMUST00000183990 | 101 nt | BASIC | 0,22 | □□□□□ -2,37 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22672-201 | ENSMUST00000104414 | 134 nt | BASIC | 0,21 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22213-201 | ENSMUST00000157564 | 119 nt | BASIC | 0,21 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm44803-201 | ENSMUST00000204384 | 156 nt | BASIC | 0,21 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Snord95-201 | ENSMUST00000082846 | 68 nt | BASIC | 0,21 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24202-201 | ENSMUST00000082948 | 103 nt | BASIC | 0,21 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26081-201 | ENSMUST00000104068 | 132 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22406-201 | ENSMUST00000174923 | 93 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir3473d-201 | ENSMUST00000175346 | 81 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm26438-201 | ENSMUST00000082593 | 107 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mirlet7a-1-201 | ENSMUST00000083487 | 94 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir196a-2-201 | ENSMUST00000083554 | 85 nt | BASIC | 0,2 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24877-201 | ENSMUST00000158779 | 116 nt | BASIC | 0,19 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24801-201 | ENSMUST00000178503 | 105 nt | BASIC | 0,19 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25055-201 | ENSMUST00000157369 | 76 nt | BASIC | 0,18 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23261-201 | ENSMUST00000158316 | 136 nt | BASIC | 0,18 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm27980-201 | ENSMUST00000184094 | 169 nt | BASIC | 0,18 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24445-201 | ENSMUST00000083981 | 107 nt | BASIC | 0,18 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir363-201 | ENSMUST00000093598 | 75 nt | BASIC | 0,18 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22004-201 | ENSMUST00000101884 | 107 nt | BASIC | 0,17 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22100-201 | ENSMUST00000157926 | 63 nt | BASIC | 0,17 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir6896-201 | ENSMUST00000198033 | 73 nt | BASIC | 0,17 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Zfp813-ps-201 | ENSMUST00000186652 | 2506 nt | BASIC | 0,17 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22720-201 | ENSMUST00000122710 | 87 nt | BASIC | 0,16 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm22140-201 | ENSMUST00000158745 | 120 nt | BASIC | 0,16 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25160-201 | ENSMUST00000158914 | 102 nt | BASIC | 0,16 | □□□□□ -2,38 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm23644-201 | ENSMUST00000157856 | 77 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25328-201 | ENSMUST00000175013 | 107 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25247-201 | ENSMUST00000175475 | 90 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm29047-201 | ENSMUST00000189816 | 108 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm44345-201 | ENSMUST00000199560 | 135 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24099-201 | ENSMUST00000083384 | 107 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24410-201 | ENSMUST00000083433 | 107 nt | BASIC | 0,15 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25756-201 | ENSMUST00000103990 | 136 nt | BASIC | 0,14 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24384-201 | ENSMUST00000122693 | 75 nt | BASIC | 0,14 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm24884-201 | ENSMUST00000158784 | 119 nt | BASIC | 0,14 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25952-201 | ENSMUST00000175329 | 74 nt | BASIC | 0,13 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Mir3967-201 | ENSMUST00000198710 | 68 nt | BASIC | 0,13 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | AC160962.3-201 | ENSMUST00000225914 | 112 nt | BASIC | 0,12 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Gm25791-201 | ENSMUST00000083292 | 137 nt | BASIC | 0,12 | □□□□□ -2,39 | | |
Prpf4b | Q61136 | Traj9-201 | ENSMUST00000103731 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 0,11 | □□□□□ -2,39 | | |
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