Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2
Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25623-201 | ENSMUST00000157216 | 108 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25887-201 | ENSMUST00000157777 | 84 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43324-201 | ENSMUST00000197482 | 289 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm6293-201 | ENSMUST00000050339 | 195 nt | BASIC | -0,87 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir18b-201 | ENSMUST00000103923 | 83 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24377-201 | ENSMUST00000104398 | 131 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22149-201 | ENSMUST00000104442 | 136 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25787-201 | ENSMUST00000104709 | 92 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir5124a-201 | ENSMUST00000175528 | 72 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | mt-Tn-201 | ENSMUST00000082399 | 71 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23722-201 | ENSMUST00000083002 | 130 nt | BASIC | -0,88 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25496-201 | ENSMUST00000104430 | 120 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43977-201 | ENSMUST00000203970 | 189 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24449-201 | ENSMUST00000083985 | 106 nt | BASIC | -0,89 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22732-201 | ENSMUST00000158093 | 121 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23864-201 | ENSMUST00000177607 | 107 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir6237-201 | ENSMUST00000183808 | 91 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43749-201 | ENSMUST00000199345 | 352 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snora62-201 | ENSMUST00000082991 | 149 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22681-201 | ENSMUST00000083853 | 106 nt | BASIC | -0,9 | □□□□□ -2,55 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23500-201 | ENSMUST00000157735 | 98 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25889-201 | ENSMUST00000157775 | 107 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24947-201 | ENSMUST00000158334 | 110 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22775-201 | ENSMUST00000177630 | 120 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23569-201 | ENSMUST00000180120 | 120 nt | BASIC | -0,91 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25565-201 | ENSMUST00000104605 | 105 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24064-201 | ENSMUST00000157486 | 106 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23726-201 | ENSMUST00000178937 | 67 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22621-201 | ENSMUST00000179678 | 74 nt | BASIC | -0,92 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24336-201 | ENSMUST00000104203 | 146 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir1898-201 | ENSMUST00000122643 | 83 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27884-201 | ENSMUST00000183865 | 76 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir5124b-201 | ENSMUST00000184251 | 85 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27607-201 | ENSMUST00000185162 | 122 nt | BASIC | -0,93 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22349-201 | ENSMUST00000157864 | 107 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir669m-1-201 | ENSMUST00000158945 | 98 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22973-201 | ENSMUST00000083298 | 191 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir23a-201 | ENSMUST00000083677 | 75 nt | BASIC | -0,94 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord72-201 | ENSMUST00000104549 | 81 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24750-201 | ENSMUST00000157843 | 104 nt | BASIC | -0,95 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25315-201 | ENSMUST00000116823 | 121 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26092-201 | ENSMUST00000179798 | 97 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir669a-1-201 | ENSMUST00000180238 | 97 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm45429-201 | ENSMUST00000209527 | 172 nt | BASIC | -0,96 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Traj53-201 | ENSMUST00000103690 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord64-201 | ENSMUST00000104003 | 67 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm14837-201 | ENSMUST00000119688 | 206 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm12086-201 | ENSMUST00000120863 | 228 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26379-202 | ENSMUST00000200225 | 132 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22813-202 | ENSMUST00000200346 | 124 nt | BASIC | -0,97 | □□□□□ -2,56 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23494-201 | ENSMUST00000116830 | 126 nt | BASIC | -0,98 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir3101-201 | ENSMUST00000175607 | 88 nt | BASIC | -0,98 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24918-201 | ENSMUST00000083022 | 130 nt | BASIC | -0,98 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mirlet7d-201 | ENSMUST00000083519 | 103 nt | BASIC | -0,98 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25431-201 | ENSMUST00000101978 | 107 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24835-201 | ENSMUST00000116777 | 111 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25622-201 | ENSMUST00000157217 | 104 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22558-201 | ENSMUST00000157326 | 95 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24467-201 | ENSMUST00000157887 | 126 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44311-201 | ENSMUST00000196448 | 69 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26225-201 | ENSMUST00000082508 | 135 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25410-201 | ENSMUST00000083758 | 137 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir3071-201 | ENSMUST00000093621 | 80 nt | BASIC | -0,99 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24468-201 | ENSMUST00000104489 | 104 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25772-201 | ENSMUST00000158574 | 56 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7673-201 | ENSMUST00000184567 | 64 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC161426.1-201 | ENSMUST00000214137 | 286 nt | BASIC | -1,01 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25316-201 | ENSMUST00000116826 | 118 nt | BASIC | -1,02 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24971-201 | ENSMUST00000175581 | 110 nt | BASIC | -1,02 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7094-2-201 | ENSMUST00000184622 | 60 nt | BASIC | -1,02 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7094-1-201 | ENSMUST00000199671 | 60 nt | BASIC | -1,02 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord49b-201 | ENSMUST00000082503 | 72 nt | BASIC | -1,02 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26018-201 | ENSMUST00000104406 | 128 nt | BASIC | -1,03 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Vmn2r-ps50-201 | ENSMUST00000209317 | 120 nt | BASIC | -1,03 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22055-201 | ENSMUST00000083388 | 107 nt | BASIC | -1,03 | □□□□□ -2,57 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24263-201 | ENSMUST00000104059 | 107 nt | BASIC | -1,04 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25879-201 | ENSMUST00000104330 | 107 nt | BASIC | -1,04 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27549-201 | ENSMUST00000183508 | 62 nt | BASIC | -1,04 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir677-202 | ENSMUST00000197076 | 78 nt | BASIC | -1,04 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23423-201 | ENSMUST00000082782 | 106 nt | BASIC | -1,04 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24714-201 | ENSMUST00000102382 | 101 nt | BASIC | -1,05 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir466b-3-201 | ENSMUST00000103806 | 81 nt | BASIC | -1,05 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25425-201 | ENSMUST00000157611 | 96 nt | BASIC | -1,05 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27735-201 | ENSMUST00000185085 | 76 nt | BASIC | -1,05 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm38298-201 | ENSMUST00000193578 | 118 nt | BASIC | -1,05 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26456-201 | ENSMUST00000082831 | 111 nt | BASIC | -1,07 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24384-201 | ENSMUST00000122693 | 75 nt | BASIC | -1,08 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | mt-Tl1-201 | ENSMUST00000082391 | 75 nt | BASIC | -1,08 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25978-201 | ENSMUST00000158698 | 90 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26233-201 | ENSMUST00000175530 | 70 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44470-201 | ENSMUST00000203913 | 142 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26131-201 | ENSMUST00000082725 | 110 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24445-201 | ENSMUST00000083981 | 107 nt | BASIC | -1,09 | □□□□□ -2,58 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm37832-201 | ENSMUST00000118935 | 189 nt | BASIC | -1,1 | □□□□□ -2,59 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23852-201 | ENSMUST00000158376 | 77 nt | BASIC | -1,1 | □□□□□ -2,59 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm45125-201 | ENSMUST00000206908 | 151 nt | BASIC | -1,1 | □□□□□ -2,59 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir369-201 | ENSMUST00000083627 | 79 nt | BASIC | -1,1 | □□□□□ -2,59 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Traj43-201 | ENSMUST00000103699 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | -1,11 | □□□□□ -2,59 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22140-201 | ENSMUST00000158745 | 120 nt | BASIC | -1,11 | □□□□□ -2,59 | | |
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