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Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5
Syna, Syncytin-A, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Syna
Q5G5D5
Gm382-201
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4070 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
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□□□□□ -2.29
Syna
Q5G5D5
Gm25040-201
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BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm22729-201
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129 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm23349-201
ENSMUST00000158432
98 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm25449-201
ENSMUST00000179389
79 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Mir509-201
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75 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
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BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Mir1949-202
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm44932-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Mir29a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
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BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24183-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm23622-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Snora75-201
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BASIC
0.7
□□□□□ -2.3
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Q5G5D5
n-R5s6-201
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24073-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24678-201
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BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm25247-201
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BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm25633-201
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BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm22950-201
ENSMUST00000082776
107 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm22354-201
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70 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm23708-201
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123 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
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Q5G5D5
Gm23528-201
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□□□□□ -2.3
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Q5G5D5
Mir6364-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
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Q5G5D5
Gm26478-201
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133 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24772-201
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110 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm23291-201
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78 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Mir376b-201
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82 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm43907-201
ENSMUST00000203128
117 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm26338-201
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110 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm6985-201
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BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Mir7010-201
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BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm28435-201
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BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm22251-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24258-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm23038-201
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104 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Syna
Q5G5D5
Gm24233-201
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BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm13065-201
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BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm26104-201
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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□□□□□ -2.31
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Gm24384-201
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm22605-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm25229-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
Gm25022-201
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Syna
Q5G5D5
Mir467a-6-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir467a-3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
Mir467a-7-201
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Syna
Q5G5D5
Mir467a-10-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir467a-5-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir467a-2-201
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir467a-9-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir467a-4-201
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
Mir467a-8-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm22677-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
Gm22732-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
CT571266.1-201
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Snord2-201
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BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
Gm27717-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm27639-201
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BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm22652-201
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131 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mirlet7a-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm25366-201
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BASIC
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□□□□□ -2.31
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Q5G5D5
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BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm26441-201
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104 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm24202-201
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103 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Mir362-201
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BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm8251-201
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5985 nt
APPRIS P1
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Olfr1099-202
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4867 nt
APPRIS P1
TSL 5
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0.6
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm22205-201
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71 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm23468-201
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BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Gm26236-201
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137 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
AC113441.1-201
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134 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
AC124196.2-201
ENSMUST00000224835
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BASIC
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□□□□□ -2.31
Syna
Q5G5D5
Snord50a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
Gm24463-201
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72 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
Gm44455-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
Gm3702-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
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BASIC
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□□□□□ -2.32
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BASIC
0.57
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Q5G5D5
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104 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
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BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
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BASIC
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□□□□□ -2.32
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Q5G5D5
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72 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Syna
Q5G5D5
Gm23012-201
ENSMUST00000104149
83 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
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