Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms