Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ptchd1Q14B62 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ptchd1Q14B62 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ptchd1Q14B62 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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