Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RabggtbP53612 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RabggtbP53612 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RabggtbP53612 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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