Protein–RNA interactions for Protein: O35134
Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Polr1a | O35134 | Gm27803-201 | ENSMUST00000183763 | 119 nt | BASIC | -2,96 | □□□□□ -2,88 | | |
Polr1a | O35134 | AC122210.2-201 | ENSMUST00000220216 | 115 nt | BASIC | -2,96 | □□□□□ -2,88 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24070-201 | ENSMUST00000104519 | 130 nt | BASIC | -2,97 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm28020-201 | ENSMUST00000157739 | 67 nt | BASIC | -2,97 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25297-201 | ENSMUST00000175490 | 67 nt | BASIC | -2,99 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -2,99 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22708-201 | ENSMUST00000158987 | 103 nt | BASIC | -2,99 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm12815-201 | ENSMUST00000121737 | 135 nt | BASIC | -3 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23351-201 | ENSMUST00000158427 | 125 nt | BASIC | -3 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Mir7-1-201 | ENSMUST00000083500 | 108 nt | BASIC | -3 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23173-201 | ENSMUST00000157161 | 160 nt | BASIC | -3,01 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23955-201 | ENSMUST00000157214 | 100 nt | BASIC | -3,02 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Olfr880-ps1-201 | ENSMUST00000212344 | 229 nt | BASIC | -3,02 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22783-201 | ENSMUST00000104089 | 107 nt | BASIC | -3,02 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25052-201 | ENSMUST00000122661 | 158 nt | BASIC | -3,02 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27539-201 | ENSMUST00000184971 | 224 nt | BASIC | -3,03 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Mir488-201 | ENSMUST00000093595 | 109 nt | BASIC | -3,03 | □□□□□ -2,89 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23909-201 | ENSMUST00000104598 | 131 nt | BASIC | -3,04 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22348-201 | ENSMUST00000178674 | 79 nt | BASIC | -3,04 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27798-201 | ENSMUST00000184989 | 71 nt | BASIC | -3,04 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24806-201 | ENSMUST00000117036 | 90 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Mir467e-201 | ENSMUST00000103760 | 87 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22199-201 | ENSMUST00000122660 | 126 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25970-201 | ENSMUST00000157165 | 86 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24246-201 | ENSMUST00000157315 | 132 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Mir5624-201 | ENSMUST00000176635 | 61 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27937-201 | ENSMUST00000183605 | 88 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm43749-201 | ENSMUST00000199345 | 352 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24538-201 | ENSMUST00000082612 | 107 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22828-201 | ENSMUST00000083768 | 107 nt | BASIC | -3,05 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm26424-201 | ENSMUST00000122530 | 104 nt | BASIC | -3,06 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | mt-Ts2-201 | ENSMUST00000082416 | 59 nt | BASIC | -3,06 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23303-201 | ENSMUST00000082714 | 152 nt | BASIC | -3,06 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24762-201 | ENSMUST00000083689 | 104 nt | BASIC | -3,06 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Mir466p-201 | ENSMUST00000103925 | 89 nt | BASIC | -3,07 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22818-201 | ENSMUST00000157446 | 104 nt | BASIC | -3,07 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | AC122320.1-201 | ENSMUST00000227233 | 105 nt | BASIC | -3,07 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22503-201 | ENSMUST00000158983 | 115 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm44853-201 | ENSMUST00000209070 | 250 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Olfr1139-ps1-201 | ENSMUST00000217634 | 168 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm26447-201 | ENSMUST00000082448 | 129 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22459-201 | ENSMUST00000082577 | 108 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Snord80-201 | ENSMUST00000083801 | 81 nt | BASIC | -3,08 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25720-201 | ENSMUST00000157503 | 105 nt | BASIC | -3,09 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24718-201 | ENSMUST00000157521 | 136 nt | BASIC | -3,09 | □□□□□ -2,9 | | |
Polr1a | O35134 | Snord19-201 | ENSMUST00000104609 | 76 nt | BASIC | -3,1 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm44149-201 | ENSMUST00000204256 | 226 nt | BASIC | -3,1 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22358-201 | ENSMUST00000082877 | 122 nt | BASIC | -3,1 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25188-201 | ENSMUST00000083913 | 122 nt | BASIC | -3,1 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25440-201 | ENSMUST00000158279 | 154 nt | BASIC | -3,1 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25370-201 | ENSMUST00000158159 | 94 nt | BASIC | -3,11 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25229-201 | ENSMUST00000178587 | 79 nt | BASIC | -3,11 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Mir7227-201 | ENSMUST00000200408 | 59 nt | BASIC | -3,12 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | CT025603.4-201 | ENSMUST00000225777 | 413 nt | BASIC | -3,12 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm28927-201 | ENSMUST00000191528 | 272 nt | BASIC | -3,13 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22401-201 | ENSMUST00000174927 | 117 nt | BASIC | -3,13 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | AC192616.1-201 | ENSMUST00000221922 | 132 nt | BASIC | -3,13 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27366-201 | ENSMUST00000184967 | 108 nt | BASIC | -3,14 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23240-201 | ENSMUST00000083009 | 121 nt | BASIC | -3,15 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24121-201 | ENSMUST00000102029 | 106 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm14883-201 | ENSMUST00000120179 | 157 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Snora15-201 | ENSMUST00000177461 | 131 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Tmsb15b2-202 | ENSMUST00000180194 | 243 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23445-201 | ENSMUST00000082800 | 107 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,91 | | |
Polr1a | O35134 | Gm11644-201 | ENSMUST00000119735 | 150 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27755-201 | ENSMUST00000184623 | 132 nt | BASIC | -3,16 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23406-201 | ENSMUST00000082537 | 122 nt | BASIC | -3,17 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25112-201 | ENSMUST00000122680 | 104 nt | BASIC | -3,18 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Mir881-201 | ENSMUST00000104844 | 78 nt | BASIC | -3,19 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25111-201 | ENSMUST00000116686 | 147 nt | BASIC | -3,19 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24393-201 | ENSMUST00000158135 | 97 nt | BASIC | -3,19 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27549-201 | ENSMUST00000183508 | 62 nt | BASIC | -3,19 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23384-201 | ENSMUST00000158593 | 103 nt | BASIC | -3,2 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Mir5619-201 | ENSMUST00000176065 | 61 nt | BASIC | -3,21 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | AC166341.3-201 | ENSMUST00000221861 | 114 nt | BASIC | -3,21 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27747-201 | ENSMUST00000184707 | 85 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23947-201 | ENSMUST00000093636 | 107 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,92 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25641-201 | ENSMUST00000175135 | 108 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25158-201 | ENSMUST00000177681 | 121 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25449-201 | ENSMUST00000179389 | 79 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm26229-201 | ENSMUST00000179699 | 121 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27476-201 | ENSMUST00000183366 | 104 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | AC126939.1-201 | ENSMUST00000224943 | 226 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Mir379-201 | ENSMUST00000083564 | 66 nt | BASIC | -3,22 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm37545-201 | ENSMUST00000186512 | 148 nt | BASIC | -3,23 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Olfr1483-ps1-201 | ENSMUST00000208241 | 334 nt | BASIC | -3,23 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24150-201 | ENSMUST00000082759 | 104 nt | BASIC | -3,23 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm24134-201 | ENSMUST00000083361 | 71 nt | BASIC | -3,23 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22772-201 | ENSMUST00000104451 | 121 nt | BASIC | -3,24 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23841-201 | ENSMUST00000116951 | 114 nt | BASIC | -3,24 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25367-201 | ENSMUST00000158846 | 106 nt | BASIC | -3,24 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm27851-201 | ENSMUST00000183529 | 63 nt | BASIC | -3,25 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25091-201 | ENSMUST00000103997 | 71 nt | BASIC | -3,26 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Mir1a-2-201 | ENSMUST00000198520 | 72 nt | BASIC | -3,28 | □□□□□ -2,93 | | |
Polr1a | O35134 | Gm22032-201 | ENSMUST00000116946 | 116 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Polr1a | O35134 | Gm26393-201 | ENSMUST00000157625 | 129 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Polr1a | O35134 | Gm23504-201 | ENSMUST00000158988 | 95 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Polr1a | O35134 | Gm25285-201 | ENSMUST00000178951 | 90 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Polr1a | O35134 | Mir466c-2-201 | ENSMUST00000180211 | 90 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Polr1a | O35134 | AC154296.2-201 | ENSMUST00000214696 | 545 nt | BASIC | -3,29 | □□□□□ -2,94 | | |
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105,1 ms