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Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7
Nphs1, Nephrin, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Nphs1
Q9QZS7
Mir6237-201
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BASIC
1.03
□□□□□ -2.24
Nphs1
Q9QZS7
mt-Tn-201
ENSMUST00000082399
71 nt
BASIC
1.03
□□□□□ -2.24
Nphs1
Q9QZS7
Mir27b-201
ENSMUST00000083541
73 nt
BASIC
1.03
□□□□□ -2.24
Nphs1
Q9QZS7
Gm37824-201
ENSMUST00000193430
3236 nt
BASIC
1.03
□□□□□ -2.24
Nphs1
Q9QZS7
Gm22212-201
ENSMUST00000158096
106 nt
BASIC
1.02
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm21954-201
ENSMUST00000179544
51 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.02
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm26466-201
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79 nt
BASIC
1.02
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm25683-201
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131 nt
BASIC
1.02
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm24431-201
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66 nt
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm22672-201
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134 nt
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm23989-201
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66 nt
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mir100-201
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80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mir5619-201
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61 nt
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
AC153930.1-201
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358 nt
TSL 3
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm23790-201
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107 nt
BASIC
1.01
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm24686-201
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93 nt
BASIC
1
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm23893-201
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134 nt
BASIC
1
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
AC211878.4-201
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262 nt
BASIC
1
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm24208-201
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135 nt
BASIC
1
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Vmn1r75-202
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6638 nt
APPRIS P2
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mir216b-201
ENSMUST00000102363
86 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm14400-201
ENSMUST00000117234
2135 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm25289-201
ENSMUST00000122799
119 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm22565-201
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69 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mir6394-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm38295-201
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151 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm44211-201
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145 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm25138-201
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136 nt
BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Snord35a-201
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BASIC
0.99
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm24648-201
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132 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm23261-201
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136 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm22429-201
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130 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm42506-201
ENSMUST00000202009
150 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mir101a-201
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83 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Mup-ps5-201
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99 nt
BASIC
0.97
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm23416-201
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95 nt
BASIC
0.97
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Snord32a-201
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83 nt
BASIC
0.97
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Gm5581-201
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2550 nt
BASIC
0.97
□□□□□ -2.25
Nphs1
Q9QZS7
Fam46d-201
ENSMUST00000101292
2995 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.96
□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Gm25056-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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61 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
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□□□□□ -2.26
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Q9QZS7
Gm23991-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Mir1949-202
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Gm43927-201
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117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
n-R5s6-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Mir3070a-201
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Gm28143-201
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Mir376b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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5036 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Mir695-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Gm23349-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
Mir7010-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
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□□□□□ -2.26
Nphs1
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□□□□□ -2.26
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□□□□□ -2.26
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
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Q9QZS7
AC122327.1-201
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
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Q9QZS7
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□□□□□ -2.26
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm26712-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
0.9
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir29a-201
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88 nt
BASIC
0.9
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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0.9
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm25300-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm23369-201
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BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir344-201
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95 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm22689-201
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BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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ENSMUST00000104221
107 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm22140-201
ENSMUST00000158745
120 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm38274-201
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148 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm44301-201
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143 nt
BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm25022-201
ENSMUST00000102205
83 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm24342-201
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104 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm23291-201
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78 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-6-201
ENSMUST00000177790
83 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-3-201
ENSMUST00000178082
83 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-7-201
ENSMUST00000178635
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-10-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-5-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-9-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
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83 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir467a-8-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm43907-201
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117 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Gm44932-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Nphs1
Q9QZS7
Mir10b-201
ENSMUST00000083566
68 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
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