Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC1,99□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1,97□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1,97□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1,97□□□□□ -2,09
SrfQ9JM73 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1,93□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1,92□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,9□□□□□ -2,1
SrfQ9JM73 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,88□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1,86□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1,86□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1,86□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1,86□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC1,86□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,84□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
SrfQ9JM73 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1,81□□□□□ -2,12
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