Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rabgef1Q9JM13 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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