Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RabggtaQ9JHK4 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtaQ9JHK4 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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