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Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0
Nicn1, Nicolin-1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Nicn1
Q9CQM0
Gm23344-201
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68 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Gm23126-201
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134 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Mir6365-201
ENSMUST00000183990
101 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Mir8116-201
ENSMUST00000184134
97 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Gm43977-201
ENSMUST00000203970
189 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Gm22981-201
ENSMUST00000082611
75 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Gm26062-201
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107 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Mir200b-201
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70 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
Nicn1
Q9CQM0
Gm25416-201
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107 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mup-ps5-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
CT009723.2-201
ENSMUST00000215702
124 nt
TSL 5
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir710-201
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110 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm23012-201
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83 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir18-201
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96 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
n-R5s18-201
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121 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm23020-201
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253 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm23291-201
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78 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Snord2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm25366-201
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124 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm44803-201
ENSMUST00000204384
156 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm24894-201
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118 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm25920-201
ENSMUST00000158307
99 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir224-201
ENSMUST00000083608
82 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm22203-201
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58 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm26007-201
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120 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir7077-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir3967-201
ENSMUST00000198710
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Snord95-201
ENSMUST00000082846
68 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir29a-201
ENSMUST00000083676
88 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Mir363-201
ENSMUST00000093598
75 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Nicn1
Q9CQM0
Gm25889-201
ENSMUST00000157775
107 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25978-201
ENSMUST00000158698
90 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir3473d-201
ENSMUST00000175346
81 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir6237-201
ENSMUST00000183808
91 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm22212-201
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106 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25952-201
ENSMUST00000175329
74 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24167-201
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124 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24028-201
ENSMUST00000178991
124 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm29047-201
ENSMUST00000189816
108 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir509-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm23761-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm22070-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25633-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir219b-201
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65 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25791-201
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137 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24772-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm22431-201
ENSMUST00000158545
107 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25161-201
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132 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir8107-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
mt-Tn-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir369-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm43885-201
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2542 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25496-201
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BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm26478-201
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BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24884-201
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BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24926-201
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BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm22632-201
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79 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm25646-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
n-R5s12-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24983-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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Nicn1
Q9CQM0
Gm27980-201
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BASIC
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Nicn1
Q9CQM0
Mir7079-201
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BASIC
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Nicn1
Q9CQM0
Gm42844-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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Nicn1
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Gm24697-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Nicn1
Q9CQM0
Mir1197-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Rab11fip4os2-202
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355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm22490-201
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm23783-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm45617-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
AC158982.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Mir196a-2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm25337-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm23788-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm25703-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Mir466-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Traj9-201
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APPRIS P1
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm26421-201
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm22406-201
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Mir6896-201
ENSMUST00000198033
73 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm22368-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm25309-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm25160-201
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BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
mt-Tv-201
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BASIC
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Nicn1
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107 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
Gm22327-201
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108 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
Nicn1
Q9CQM0
AC166341.8-201
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108 nt
BASIC
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Nicn1
Q9CQM0
AC125190.3-201
ENSMUST00000223224
121 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
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