Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-1,99□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC-2□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-2,01□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-2,02□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC-2,02□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-2,02□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
Sft2d1Q5SSN7 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
Sft2d1Q5SSN7 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-2,12□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
Sft2d1Q5SSN7 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-2,18□□□□□ -2,76
Sft2d1Q5SSN7 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-2,19□□□□□ -2,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms