Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd1Q01822 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd1Q01822 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd1Q01822 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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