Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RabggtbP53612 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RabggtbP53612 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms