Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ArxO35085 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ArxO35085 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ArxO35085 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ArxO35085 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ArxO35085 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ArxO35085 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ArxO35085 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ArxO35085 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ArxO35085 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ArxO35085 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ArxO35085 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ArxO35085 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ArxO35085 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ArxO35085 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ArxO35085 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms