Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cdh18E9Q9Q6 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cdh18E9Q9Q6 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Cdh18E9Q9Q6 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Cdh18E9Q9Q6 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cdh18E9Q9Q6 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cdh18E9Q9Q6 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cdh18E9Q9Q6 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cdh18E9Q9Q6 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cdh18E9Q9Q6 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cdh18E9Q9Q6 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cdh18E9Q9Q6 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 904.3 ms