Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0,54□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-0,55□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0,55□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0,55□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,5
Usf3B2RUQ2 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Usf3B2RUQ2 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0,65□□□□□ -2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106,1 ms