Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Grik3B1AS29 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Grik3B1AS29 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Grik3B1AS29 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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