Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0,34□□□□□ -2,46
Nphp1Q9QY53 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0,35□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0,36□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0,37□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0,38□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0,39□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0,4□□□□□ -2,47
Nphp1Q9QY53 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-0,41□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0,41□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0,41□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0,42□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0,44□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Nphp1Q9QY53 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Nphp1Q9QY53 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99,2 ms