Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cln8Q9QUK3 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cln8Q9QUK3 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Cln8Q9QUK3 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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