Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rabgef1Q9JM13 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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