Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RabggtaQ9JHK4 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RabggtaQ9JHK4 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RabggtaQ9JHK4 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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