Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms