Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Atg4cQ811C2 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Atg4cQ811C2 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Atg4cQ811C2 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Atg4cQ811C2 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms