Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mir1912-201ENSMUST00000175298 87 ntBASIC-1,76□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-1,76□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC-1,77□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-1,78□□□□□ -2,69
NipblQ6KCD5 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-1,79□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir367-201ENSMUST00000083479 75 ntBASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1,8□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23428-201ENSMUST00000122488 102 ntBASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1,81□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-1,82□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-1,82□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC-1,82□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-1,82□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC-1,83□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Mir154-201ENSMUST00000083514 66 ntBASIC-1,84□□□□□ -2,7
NipblQ6KCD5 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-1,85□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-1,86□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-1,87□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-1,88□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
NipblQ6KCD5 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-1,89□□□□□ -2,71
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