Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Trappc1Q5NCF2 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Trappc1Q5NCF2 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Trappc1Q5NCF2 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms