Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ptchd1Q14B62 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm22071-201ENSMUST00000116857 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ptchd1Q14B62 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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