Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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