Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rabgef1Q9JM13 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Rabgef1Q9JM13 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rabgef1Q9JM13 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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