Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RabggtaQ9JHK4 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RabggtaQ9JHK4 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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