Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Apobec3Q99J72 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
Apobec3Q99J72 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Apobec3Q99J72 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.6 ms