Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp38Q8BW70 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Usp38Q8BW70 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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Usp38Q8BW70 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp38Q8BW70 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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