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Protein–RNA interactions for Protein: Q62395
Tff3, Trefoil factor 3, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Tff3
Q62395
Gm10719-202
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675 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
mt-Nd4-201
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1378 nt
APPRIS P1
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Traj53-201
ENSMUST00000103690
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm24016-201
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68 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
AC154506.3-201
ENSMUST00000225417
213 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm23733-201
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106 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm25121-201
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BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
AC098718.2-201
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BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm22573-201
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102 nt
BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm22055-201
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BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Mir509-201
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BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
Gm44554-201
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BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
Tff3
Q62395
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APPRIS P1
BASIC
-4.1
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24192-201
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145 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25995-201
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142 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm27285-201
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127 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Mir7673-201
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64 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Mir154-201
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BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25512-201
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BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25823-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24374-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24220-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25988-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm23471-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm26488-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm23449-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25221-201
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BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Mir488-201
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BASIC
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□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24070-201
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BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24836-201
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BASIC
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□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm25014-201
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BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Vmn2r-ps116-201
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BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm24799-201
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BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm23538-201
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BASIC
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□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm10717-207
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Mir133a-1-201
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BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
Gm27699-201
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BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
Gm22071-201
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BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
Gm22459-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Mir764-201
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Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Mir743b-201
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BASIC
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□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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Q62395
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm25937-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm21961-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.21
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Tff3
Q62395
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BASIC
-4.21
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Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.22
□□□□□ -3.08
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.23
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.23
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22597-201
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BASIC
-4.24
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm27624-201
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BASIC
-4.24
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Traj49-202
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62 nt
APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
AC165157.3-201
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103 nt
BASIC
-4.24
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
AC164297.3-201
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BASIC
-4.24
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22148-201
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107 nt
BASIC
-4.25
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22215-201
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96 nt
BASIC
-4.25
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm45005-201
ENSMUST00000206640
157 nt
BASIC
-4.25
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Mir5619-201
ENSMUST00000176065
61 nt
BASIC
-4.26
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
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517 nt
BASIC
-4.26
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm23320-201
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127 nt
BASIC
-4.27
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm12924-201
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318 nt
BASIC
-4.27
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22708-201
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103 nt
BASIC
-4.27
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22290-201
ENSMUST00000177655
107 nt
BASIC
-4.27
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm23811-201
ENSMUST00000175155
84 nt
BASIC
-4.28
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm25618-201
ENSMUST00000179484
107 nt
BASIC
-4.28
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm27937-201
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88 nt
BASIC
-4.28
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
AC109214.2-201
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358 nt
BASIC
-4.28
□□□□□ -3.09
Tff3
Q62395
Gm22790-201
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129 nt
BASIC
-4.29
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Mir1912-201
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87 nt
BASIC
-4.29
□□□□□ -3.1
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Q62395
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ENSMUST00000227138
187 nt
BASIC
-4.29
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Spinkl-201
ENSMUST00000066328
593 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
-4.29
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm25749-201
ENSMUST00000175485
111 nt
BASIC
-4.3
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Mir195b-201
ENSMUST00000184814
97 nt
BASIC
-4.3
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Q62395
AC157602.1-201
ENSMUST00000197446
105 nt
BASIC
-4.3
□□□□□ -3.1
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Q62395
Gm44339-201
ENSMUST00000200598
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BASIC
-4.3
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm24201-201
ENSMUST00000082946
125 nt
BASIC
-4.3
□□□□□ -3.1
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