Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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Ttf1Q62187 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ttf1Q62187 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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Ttf1Q62187 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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Ttf1Q62187 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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