Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Sft2d1Q5SSN7 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms