Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2
Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm45002-201 | ENSMUST00000208045 | 120 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24524-201 | ENSMUST00000082925 | 170 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23814-201 | ENSMUST00000083230 | 102 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23012-201 | ENSMUST00000104149 | 83 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24374-201 | ENSMUST00000104394 | 106 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23253-201 | ENSMUST00000157441 | 104 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24843-201 | ENSMUST00000158682 | 76 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23918-201 | ENSMUST00000175253 | 106 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir6394-201 | ENSMUST00000184738 | 99 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44922-201 | ENSMUST00000206690 | 90 nt | BASIC | -0,41 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25416-201 | ENSMUST00000104221 | 107 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir6985-201 | ENSMUST00000184641 | 61 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir191-201 | ENSMUST00000196210 | 74 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC124687.1-201 | ENSMUST00000221868 | 189 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC159885.1-201 | ENSMUST00000222221 | 199 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23378-201 | ENSMUST00000082942 | 107 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25629-201 | ENSMUST00000084001 | 107 nt | BASIC | -0,42 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Traj9-201 | ENSMUST00000103731 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir219b-201 | ENSMUST00000198317 | 65 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26204-201 | ENSMUST00000082906 | 107 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir200b-201 | ENSMUST00000083615 | 70 nt | BASIC | -0,43 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22105-201 | ENSMUST00000116734 | 116 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25338-201 | ENSMUST00000116849 | 120 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24772-201 | ENSMUST00000158507 | 110 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25366-201 | ENSMUST00000158845 | 124 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC154390.1-201 | ENSMUST00000225629 | 277 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir214-201 | ENSMUST00000083582 | 110 nt | BASIC | -0,44 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | n-R5s39-201 | ENSMUST00000122613 | 108 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22966-201 | ENSMUST00000157957 | 129 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22942-201 | ENSMUST00000158563 | 124 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Traj61-201 | ENSMUST00000165025 | 72 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25032-201 | ENSMUST00000175411 | 84 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25141-201 | ENSMUST00000083177 | 107 nt | BASIC | -0,45 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir21c-201 | ENSMUST00000184910 | 78 nt | BASIC | -0,46 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | 2210418O10Rik-202 | ENSMUST00000135430 | 195 nt | TSL 5 BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23901-201 | ENSMUST00000157570 | 107 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22100-201 | ENSMUST00000157926 | 63 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22675-201 | ENSMUST00000158430 | 104 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7009-201 | ENSMUST00000184519 | 64 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43907-201 | ENSMUST00000203128 | 117 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir344-201 | ENSMUST00000083634 | 95 nt | BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm6358-201 | ENSMUST00000089101 | 156 nt | APPRIS ALT2 BASIC | -0,47 | □□□□□ -2,48 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm21940-201 | ENSMUST00000204940 | 2278 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25680-201 | ENSMUST00000116917 | 126 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22635-201 | ENSMUST00000116962 | 126 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord2-201 | ENSMUST00000157899 | 69 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AL845349.1-201 | ENSMUST00000213794 | 78 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC125190.3-201 | ENSMUST00000223224 | 121 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25482-201 | ENSMUST00000083225 | 107 nt | BASIC | -0,48 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43885-201 | ENSMUST00000204928 | 2542 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25274-201 | ENSMUST00000104296 | 135 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23531-201 | ENSMUST00000104567 | 68 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25060-201 | ENSMUST00000157374 | 130 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24054-201 | ENSMUST00000158619 | 105 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir8090-201 | ENSMUST00000185078 | 136 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm37624-201 | ENSMUST00000193751 | 219 nt | BASIC | -0,49 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24887-201 | ENSMUST00000104386 | 108 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24555-201 | ENSMUST00000104548 | 124 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22720-201 | ENSMUST00000122710 | 87 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25055-201 | ENSMUST00000157369 | 76 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23977-201 | ENSMUST00000177871 | 74 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7038-201 | ENSMUST00000184833 | 71 nt | BASIC | -0,5 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm12013-201 | ENSMUST00000121971 | 155 nt | BASIC | -0,51 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22139-201 | ENSMUST00000158747 | 105 nt | BASIC | -0,51 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23483-201 | ENSMUST00000104179 | 108 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26011-201 | ENSMUST00000104410 | 104 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23260-201 | ENSMUST00000158317 | 172 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23258-201 | ENSMUST00000158319 | 106 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22087-201 | ENSMUST00000158339 | 88 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26097-201 | ENSMUST00000179642 | 93 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27465-201 | ENSMUST00000184290 | 91 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44338-201 | ENSMUST00000198614 | 110 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24522-201 | ENSMUST00000083964 | 108 nt | BASIC | -0,52 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord67-201 | ENSMUST00000104033 | 111 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24246-201 | ENSMUST00000157315 | 132 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24686-201 | ENSMUST00000157755 | 93 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24399-201 | ENSMUST00000157869 | 74 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Ighv15-1-201 | ENSMUST00000194450 | 276 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir466e-201 | ENSMUST00000198862 | 84 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir466c-1-201 | ENSMUST00000200654 | 84 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26438-201 | ENSMUST00000082593 | 107 nt | BASIC | -0,53 | □□□□□ -2,49 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23900-201 | ENSMUST00000157569 | 108 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22337-201 | ENSMUST00000157721 | 132 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23209-201 | ENSMUST00000158667 | 110 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25993-201 | ENSMUST00000175391 | 80 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26712-201 | ENSMUST00000180813 | 217 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44409-201 | ENSMUST00000198810 | 166 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Traj49-202 | ENSMUST00000199452 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC158982.2-201 | ENSMUST00000226283 | 184 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir145a-201 | ENSMUST00000083658 | 70 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25337-201 | ENSMUST00000083723 | 104 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23947-201 | ENSMUST00000093636 | 107 nt | BASIC | -0,54 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22373-201 | ENSMUST00000104584 | 89 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir669g-201 | ENSMUST00000116809 | 123 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26091-201 | ENSMUST00000122704 | 82 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22606-201 | ENSMUST00000158290 | 103 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22088-201 | ENSMUST00000158341 | 117 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm7258-201 | ENSMUST00000179317 | 300 nt | BASIC | -0,55 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir802-201 | ENSMUST00000103258 | 97 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir466b-8-201 | ENSMUST00000103883 | 86 nt | BASIC | -0,56 | □□□□□ -2,5 | | |
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