Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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Gtpbp6Q3U6U5 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gtpbp6Q3U6U5 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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