Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0,82□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0,81□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC0,8□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC0,79□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0,78□□□□□ -2,28
Trim71Q1PSW8 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0,77□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0,76□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC0,75□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0,74□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC0,74□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0,74□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0,74□□□□□ -2,29
Trim71Q1PSW8 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0,74□□□□□ -2,29
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