Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ptchd1Q14B62 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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ptchd1Q14B62 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ptchd1Q14B62 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
ptchd1Q14B62 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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