Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sh3bp2Q06649 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sh3bp2Q06649 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Sh3bp2Q06649 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Sh3bp2Q06649 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sh3bp2Q06649 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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