Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Hoxd1Q01822 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Hoxd1Q01822 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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