Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Rpl28P41105 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Rpl28P41105 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms