Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Grik3B1AS29 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Grik3B1AS29 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Grik3B1AS29 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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