Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col4a3Q9QZS0 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col4a3Q9QZS0 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col4a3Q9QZS0 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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