Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Limd1Q9QXD8 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Limd1Q9QXD8 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Limd1Q9QXD8 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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