Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC0,12□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0,12□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0,11□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0,1□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0,1□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC0,1□□□□□ -2,39
Cabp1Q9JLK7 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0,09□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0,09□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0,09□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC0,08□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC0,08□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0,08□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0,08□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC0,07□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0,06□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC0,05□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0,05□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0,05□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0,04□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0,03□□□□□ -2,4
Cabp1Q9JLK7 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0,01□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0,02□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-0,03□□□□□ -2,41
Cabp1Q9JLK7 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Cabp1Q9JLK7 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Cabp1Q9JLK7 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Cabp1Q9JLK7 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Cabp1Q9JLK7 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0,04□□□□□ -2,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108,4 ms