Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ccdc86Q9JJ89 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc86Q9JJ89 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc86Q9JJ89 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.2 ms