Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RabggtaQ9JHK4 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RabggtaQ9JHK4 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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